有多种方法可以控制云主机上的Linux系统，以下是几种常见的方法：

1. SSH（Secure Shell）：SSH是一种加密的网络协议，可以通过该协议远程登录到Linux云主机并执行命令。使用SSH，您可以通过终端或SSH客户端连接到云主机，并在命令行界面上执行命令。

2. 控制面板：许多云服务提供商都提供了自己的控制面板，您可以通过Web界面来管理和控制云主机。

3. VNC（Virtual Network Computing）：VNC是一种远程桌面协议，可以通过该协议远程访问云主机的桌面环境。通过VNC，您可以像操作本地计算机一样操作远程云主机的界面。

4. 命令行工具：许多云服务提供商提供命令行工具，您可以使用这些工具在本地计算机上执行命令来控制云主机。例如，AWS提供了AWS CLI（命令行界面），您可以使用该工具来管理和控制AWS云主机。

需要注意的是，具体的控制方法可能因云服务提供商的不同而有所差异，您可以根据您使用的云服务提供商和具体需求选择适合的方法。