云服务器网站备份的方法有以下几种：

手动备份：手动将网站文件和数据库文件拷贝到本地或其他存储设备上进行备份。这种方法需要手动操作，容易出错且费时费力。

自动备份：使用定时任务或脚本来自动备份网站文件和数据库文件。可以设置备份频率和保存时间，减少人工干预，提高备份效率。

备份工具：使用备份工具来进行网站备份，如cPanel、Plesk等控制面板提供的备份功能，或者使用第三方备份工具如rsync、rclone等。

增量备份：对已备份的网站文件和数据库文件进行增量备份，只备份发生变化的部分，可以减少备份存储空间和备份时间。

镜像备份：将整个云服务器的系统镜像进行备份，包括操作系统、网站文件、数据库等。可以恢复整个系统到备份时的状态，但备份文件较大。

无论使用哪种备份方法，都应该将备份文件保存在不同的位置，确保数据的安全性。此外，备份文件的加密和压缩也是提高备份效率和安全性的重要措施。