在MySQL中，查询超时可以通过设置wait_timeout参数来调整。wait_timeout参数表示MySQL服务器在关闭空闲连接之前等待活动连接的秒数。

以下是设置查询超时的步骤：

登录到MySQL服务器。

运行以下命令来检查当前的wait_timeout值：

SHOW VARIABLES LIKE 'wait_timeout';

如果需要更改wait_timeout值，可以使用以下命令来更改：

SET GLOBAL wait_timeout = <new_value>;

其中<new_value>为新的查询超时时间，以秒为单位。

确认新的设置是否生效，再次运行以下命令来检查wait_timeout值：

SHOW VARIABLES LIKE 'wait_timeout';

请注意，更改wait_timeout值将会影响整个MySQL服务器，所有连接的查询超时时间都会被修改。