要修改MySQL的pid文件目录，可以按照以下步骤操作：

打开MySQL的配置文件。在Linux上，配置文件通常位于/etc/mysql/my.cnf或/etc/my.cnf；在Windows上，配置文件通常位于C:\Program Files\MySQL\MySQL Server X.X\my.ini。

在配置文件中找到[mysqld]部分，并添加或修改下面的行：pid-file=/path/to/new/pid/file.pid

将"/path/to/new/pid/file.pid"替换为您想要设置的新pid文件的目录和文件名。

保存并关闭配置文件。

重新启动MySQL服务，以使更改生效。

注意：在修改pid文件目录之前，请确保新目录对于MySQL用户可写，并且没有其他进程正在使用该文件名。启动MySQL服务时，它将尝试在新目录中创建一个新的pid文件。