MySQL中的聚簇索引和非聚簇索引有以下区别：

数据存储方式：聚簇索引定义了表中数据的物理存储顺序，即表中的行按照聚簇索引的顺序进行存储。而非聚簇索引只是指向数据行的指针，它们与实际数据在磁盘上的存储位置无关。

唯一性：表中只能有一个聚簇索引，因为它决定了数据的存储顺序。但是表可以有多个非聚簇索引。

查询性能：聚簇索引对于范围查询和排序操作的性能更好，因为相关的数据行在物理上存储在一起。而非聚簇索引在范围查询和排序操作时需要额外的IO操作来获取相关的数据行。

更新性能：对于插入、删除和更新操作，聚簇索引的性能可能较差，因为需要重新组织数据的物理存储顺序。而非聚簇索引的更新性能较好，因为只需要更新索引。

索引大小：聚簇索引的大小通常比非聚簇索引大，因为它包含了实际数据。而非聚簇索引只包含索引列的值和指向实际数据行的指针。

需要根据具体的场景和需求来选择适合的索引类型。