要在RHadoop中兼容不同版本的Hadoop，可以通过以下方式实现：

安装对应版本的RHadoop包：根据使用的Hadoop版本，安装对应版本的RHadoop包。可以在CRAN上搜索RHadoop包，并选择与Hadoop版本兼容的版本进行安装。

配置Hadoop集群：确保Hadoop集群中的各个节点都安装了相同版本的Hadoop，并且配置正确。RHadoop需要与Hadoop集群通信，因此要确保集群中所有节点的配置是一致的。

设置环境变量：在R中设置环境变量，指定Hadoop的安装路径和版本信息。可以通过设置HADOOP_CMD、HADOOP_STREAMING等环境变量来指定Hadoop的相关信息。

测试连接：在R中使用RHadoop包中的函数连接到Hadoop集群，并测试是否能够正常读取和写入数据。可以使用rhdfs和rmr2包中的函数来连接HDFS和执行MapReduce任务。

通过以上步骤，可以实现在RHadoop中兼容不同版本的Hadoop，从而实现在R中对Hadoop集群进行数据处理和分析。