Hadoop去重的工作原理通常是通过MapReduce任务来实现的。具体步骤如下：

输入数据被切分成多个小块，并由若干个Mapper并行处理。Mapper将每条记录进行处理，以记录中的某个字段作为key，将整条记录作为value输出。每个Mapper输出的key-value对会经过Shuffle和Sort阶段，相同key的记录会被聚合在一起。Reducer接收到相同key的记录集合，对记录进行去重操作，只保留一条记录。Reducer将去重后的记录输出，作为最终的输出结果。

通过MapReduce任务，Hadoop可以对大规模数据进行去重操作，从而实现数据的清洗和整理工作。