如果Anaconda没有彻底卸载干净，可能会导致以下后果：

系统性能下降：未完全卸载的Anaconda可能会影响系统的性能，导致系统变得缓慢或不稳定。

冲突和错误：残留的Anaconda文件可能会与其他软件或系统组件产生冲突，导致程序错误或崩溃。

存储空间浪费：未完全卸载的Anaconda文件会占用存储空间，导致存储空间浪费。

安全隐患：未完全卸载的Anaconda可能会留下安全漏洞，使系统容易受到攻击或恶意软件感染。

为了避免以上问题，建议在卸载Anaconda时确保彻底删除所有相关文件和注册表项。可以使用官方提供的卸载工具或手动删除残留文件来确保彻底卸载Anaconda。