要优化Ubuntu上MongoDB的存储空间，可以采取以下措施：

选择合适的数据类型：

使用合适的数据类型可以减少存储空间的使用。例如，避免使用过大的数据类型（如字符串）来存储较小的值。

启用压缩：

MongoDB支持多种压缩算法，如Snappy、Zlib等。启用压缩可以减少存储空间的使用，但可能会降低查询性能。你可以根据实际需求选择合适的压缩算法。

删除不再需要的数据：

定期检查数据库，删除不再需要的文档和数据，以减少存储空间的使用。

使用数据分片：

如果数据量非常大，可以考虑使用数据分片来分散存储空间的使用。数据分片可以将数据分布在多个服务器上，从而提高查询性能和存储空间的利用率。

清理日志文件：

MongoDB会生成各种日志文件，这些文件会占用存储空间。定期清理和归档这些日志文件，可以减少存储空间的使用。

使用数据库备份和恢复：

定期对数据库进行备份，并将备份文件存储在另一个硬盘或存储设备上。这样，在需要时可以使用备份文件恢复数据，从而减少存储空间的使用。

优化索引：

合理使用索引可以减少存储空间的使用，同时提高查询性能。避免创建过多的索引，因为每个索引都会占用存储空间。

使用TTL索引：

对于有时间限制的数据，可以使用TTL（Time-To-Live）索引来自动删除过期的文档。这样可以减少存储空间的使用，同时避免手动删除过期数据。

压缩数据库：

使用 compact 命令来压缩数据库，释放未使用的空间。

监控和调整：

定期监控数据库的存储空间使用情况，根据实际情况进行调整。例如，如果发现某个集合的存储空间使用过高，可以考虑优化该集合的数据结构或删除不再需要的数据。

内存管理：

调整WiredTiger缓存大小：通过配置文件 storage.wiredTiger.engineConfig.cacheSizeGB 参数来控制MongoDB使用的内存量。这个值通常建议设置为服务器总内存的60%-80%。

使用SSD：

使用固态硬盘（SSD）替代传统硬盘，可以显著提升数据读写速度。

查询优化：

优化查询语句：避免全表扫描，使用范围查询、分页查询等方式来提高查询效率。使用投影查询：只返回需要的字段，减少数据传输量。

通过上述措施，可以有效优化Ubuntu上MongoDB的存储空间，提高数据库的性能和稳定性。在进行任何优化操作之前，建议先在测试环境中验证优化效果，并根据实际情况进行调整。