在Java中生成XML文件的常用方式包括：

使用DOM (Document Object Model)：使用Java的DOM API可以创建一个XML文档，并通过操作节点来构建XML结构。

使用SAX (Simple API for XML)：SAX是一种基于事件的XML解析器，可以用于读取和生成XML文档。

使用JAXB (Java Architecture for XML Binding)：JAXB是Java提供的一种XML绑定工具，可以将Java对象映射到XML文档中。

使用StAX (Streaming API for XML)：StAX是一种流式XML处理API，可以用于读取和生成XML文档。

使用JDOM：JDOM是一个简单而直观的API，可以用于创建、读取和操作XML文档。

使用XStream：XStream是一个支持对象和XML之间相互转换的库，可以将Java对象序列化为XML文档，也可以从XML文档反序列化为Java对象。