要在Tomcat中运行Java程序，您可以创建一个动态Web项目，并将其部署到Tomcat服务器中。

以下是一些简单的步骤：

在Eclipse或其他IDE中创建一个动态Web项目。将您的Java程序放入该项目的src文件夹中。创建一个Servlet类或JSP页面来调用您的Java程序。将该项目部署到Tomcat服务器中。启动Tomcat服务器，并访问您的Java程序所在的URL。

这样，您的Java程序就会在Tomcat服务器上运行。您也可以使用Tomcat的管理界面来监控您的应用程序的运行情况。