在Ubuntu系统上进行MongoDB的数据迁移，通常涉及以下几个步骤：

备份源数据库：使用mongodump命令来备份源数据库。这个命令会导出数据库中的所有数据和索引信息。

mongodump --db 源数据库名 --out /备份路径

例如，如果你想备份名为mydatabase的数据库，并将备份文件存储在/backups/mydatabase目录下，你可以运行：

mongodump --db mydatabase --out /backups/mydatabase

准备目标数据库：确保目标MongoDB实例已经安装并运行。如果目标数据库是新安装的，你需要先启动MongoDB服务。

sudo systemctl start mongod

恢复数据到目标数据库：使用mongorestore命令将备份的数据恢复到目标数据库。

mongorestore --db 目标数据库名 /备份路径/源数据库名

例如，如果你想将备份恢复到名为mydatabase的目标数据库，你可以运行：

mongorestore --db mydatabase /backups/mydatabase/mydatabase

验证数据迁移：在目标数据库上执行一些查询，确保数据已经正确迁移。

mongo 目标数据库名

然后在mongo shell中执行查询，例如：

db.集合名.find().pretty()

清理（可选）：如果迁移成功，你可以删除源数据库的备份文件以释放空间。

rm -rf /备份路径/源数据库名

请注意，如果你的MongoDB实例启用了身份验证，你可能需要在mongodump和mongorestore命令中提供用户名和密码。

此外，如果你的源数据库和目标数据库不在同一个MongoDB实例上，或者你需要迁移跨版本的数据，可能需要考虑使用其他工具或方法，例如mongoexport和mongoimport命令，或者使用MongoDB的复制功能。

在执行数据迁移之前，请确保你已经阅读了MongoDB官方文档中关于数据迁移的最佳实践和指南。