sankey_plot.r如何绘制桑基图

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绘制桑基图（冲击图）

使用方法:

usage:script/sankey_plot.r[-h]-iinput-ggroup[group...]-ccolor[-ooutdir][-pprefix][-Hheight][-Wwidth]Sankeyplotdrawingoptionalarguments:-h,--helpshowthishelpmessageandexit-iinput,--inputinputinputthematrix[required]-ggroup[group...],--groupgroup[group...]inputcolumnnamesofthreegroups[required]-ccolor,--colorcolorcolumntofillcolor[required]-ooutdir,--outdiroutdiroutputfiledirectory[defaultcwd]-pprefix,--prefixprefixoutfilenameprefix[defaultresult]-Hheight,--heightheighttheheightofpicinches[default5]-Wwidth,--widthwidththewidthofpicinches[default5]

参数说明：

-i包含具有对应关系的数据

Immune_Subtype	m6acluster	group
C1	C2	high
C2	C1	low

-g 输入所要绘制桑基图的三列数据的列名

-c 决定分流所填充颜色的列名

使用举例：

Rscriptscript/sankey_plot.r-i/share/nas1/fangs/test/m6A/TCGA-KIRC/06.m6a_score/metadata_group.tsv-gm6aclusterImmune_Subtypegroup-cm6acluster-pdemo

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